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雖然珊瑚不能移動，但許多海洋生物和人類都倚賴著牠而存活。它可以鞏固海岸線，避免海浪侵蝕海岸；繽紛亮麗的生物，更是目前海洋生態旅遊的重要觀光資源之ㄧ；近年來，科學家更由珊瑚礁生物上萃取到許多可以應用到醫學治療的化學物質；最重要的是，牠可以提供其他海洋生物居住的棲地，維繫海洋生物多樣性，也因此，從古至今，珊瑚礁區也是提供人類漁獲重要來源之ㄧ。珊瑚是ㄧ種對環境極為敏感的動物，合適的水溫，乾淨的海水，才能生存。從以上總總功能與特性，我們可以了解珊瑚不只是ㄧ種重要且珍貴的動物，更是其他海洋生物所依賴的重要棲地。然而，因為人類不斷的消耗珊瑚礁及污染其生存的海域，科學家評估到西元2030年，全球珊瑚礁將有30%受到嚴重破壞，而有60%珊瑚礁將全部消失。

目前，珊瑚礁面臨許多威脅，比如當我們開發海岸地時，常常因為不當的施工設計與規劃，造成許多泥砂流到海洋，覆蓋在珊瑚礁上導致珊瑚死亡；而有些水族館商人，採用毒魚、電魚等方式，抓取觀賞用的珊瑚礁魚類；或者，為了滿足大量愛吃現撈的觀光客，產生過度的捕魚情形，有些漁民更是貪圖一時的方便，用炸魚的方式，獲取魚獲；這樣過度及不當的捕魚方式，不僅大量減少珊瑚礁魚類數量，更可能直接或間接影響珊瑚的生存。而觀光遊憩的大量湧入，不正確的海上活動，如浮潛時直接踩踏在珊瑚上，補抓海洋生物等，也會破壞珊瑚，影響珊瑚礁生態。另外，近年來受全球暖化，氣候變遷的影響，不斷上升的海水溫度，導致珊瑚白化情形嚴重；然而從1990年起，更有科學家發現珊瑚感染許多新的未知疾病，因而死亡。

過去二十年，全球珊瑚疾病最嚴重的地區在加勒比海海域，80%的珊瑚受到疾病的威脅與感染，約有30種疾病被記錄研究，但許多疾病仍不清楚確切的致病因子為何；與台灣同樣位於太平洋海域的大堡礁，過去五年來所記錄的珊瑚疾病機率也逐漸增加，主要威脅的珊瑚疾病有 :

黑帶病(Black Band Disease )

白帶病(White Band Diseases )(攝影 : ©Bruckner AW)

黃帶病(Yellow Band Disease)(攝影 : ©Coral Cay Conservation)

白疫病(White Plague Disease)(攝影 : ©Garrison G)

黑腐化症( Aspergillosis)(攝影 : ©Weil E)

粉紅斑病(Pink Line Syndrome)(攝影: Andrew Bruckner, PhD)

骨骼帶狀侵蝕病(Skeletal Eroding Band)、珊瑚腫瘤(Growth Anomalies)等。

 

根據研究，有些珊瑚疾病只會好發在某些特定的珊瑚，比如黑腐化症只被觀察在海扇，而粉紅點並較常見於團塊狀的微孔珊瑚；而疾病發生到死亡的速度，每種疾病不同，以黑帶病為例，其速度可以以每天4公厘的速度慢慢擴大至整顆珊瑚死亡。目前，科學家只能根據研究資料推測疾病發生和大量富含營養鹽的污水和沉積物排入海洋中，使海洋中的致病細菌增加，並造成珊瑚免疫力下降，易受致病菌感染，而更多資料顯示，上升的海水溫度，增加這些病原菌的活動力或是數量，導致珊瑚疾病發生的機率更高。因此，珊瑚在受到致病菌不斷的攻擊之下，快速死亡。

在綠島發現許多珊瑚變成黑色而死亡，稱為黑病，經科學家仔細觀察研究後，發現此黑病主要是由一種如皮膚般細薄的黑皮海綿大量生長，覆蓋珊瑚，導致珊瑚死亡；根據記錄，這種情形在20年前日本關島的珊瑚礁海域也被發現過，而被黑皮海綿覆蓋而死的珊瑚棲地很難再回覆原本海中熱帶雨林的樣貌。目前許多科學家仍努力希望了解黑皮海綿大量生長的原因，是天敵減少或是環境營養鹽或溫度變化導致黑皮海綿大量生長，以及珊瑚是否因為環境惡化，導致免疫力下降容易受到黑皮海綿攻擊，種種可能的因素都需要更多的研究來釐清。