薏苡臺中一號與臺中三號之DNA條碼 - 農業知識入口網

本場所育成之薏苡臺中一號及臺中三號為國內栽培之主要品種，其中臺中一號萃取物已被運用於醫藥研究，並申請進入臨床試驗階段，有必要建立品種基因條碼，作為基原鑑定之用。本研究以薏苡臺中一號、三號、野生種薏苡UK accession ABY BS3985及小珠薏苡為材料，參考基因條碼相關文獻所建議之引子對，進行基因選殖與定序，並以發表之薏苡葉綠體基因序列為基礎，進行選殖序列的比對分析。本研究共選殖20條葉綠體基因條並完成定序比對，分析序列涵蓋1/10之葉綠體基因組，在所分析之基因中，臺中一號和臺中三號的基因序列完全相同，trnH-psbA、rps16-trnQ、atpH-atpI、rps18-rps12、psbB Exon、ccsA-ndhD等六個基因和登錄於NCBI 核酸資料庫之薏苡葉綠體參考序列有多型性，其中三個為插入或刪除，基因條碼變異主要出現在基因間隔區。另選殖核醣體內轉錄間隔區，定序結果發現與參考基因具有更高的多型性，共有四個核酸變異皆為C-T轉變，結果已登錄於NCBI之核酸資料庫，可作為基因條碼鑑定之用。