基於遺傳結構之番椒核心種原建立與應用
本研究旨在建立以遺傳結構為基礎之番椒(Capsicum spp.)核心種原,以促進遺傳資源之保存與應用。本研究自國家種原庫蒐集1,011份番椒材料,採用雙重酶切DNA定序技術進行基因體分析,共獲得6,437個高品質單核苷酸多型性位點。族群結構分析顯示番椒種原可分為四大遺傳族群,其基因型與外表型變異具高度對應關係,反映族群遺傳結構與性狀表現之關聯性。進一步之連鎖不平衡分析顯示番椒種間之基因體分化特徵,可作為後續全基因體關聯性研究之分子標誌密度參考。基於此些遺傳背景資訊,本研究採雙階段策略建立番椒核心種原,首先建立涵蓋250個種原之番椒核心種原,再逐步縮減為涵蓋200、150、100及50個種原之番椒核心種原,此些核心種原保留89.4%以上之等位基因多樣性。為驗證核心種原之實用性,本研究將番椒核心種原應用於番椒微斑病毒(pepper mild mottle virus; PMMoV)抗性評估,結果顯示Pcc2、Pcc55與Pcc167等種原具抗病潛力。本研究建立之番椒核心種原為番椒遺傳資源之保存與應用奠定新的基礎,亦可作為後續抗逆境篩選與全基因體關聯分析等研究之重要材料。
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