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苗栗區農業改良場111年年報-草莓炭疽病行動化田間即時檢測技術之開發與應用
作者:苗栗區農業改良場
公佈日期:112 年 10 月 16 日
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為因應草莓炭疽病檢測行動工作站現地分析作業之進行,本場完成非動力式核酸萃取套組開發及測試。完成核酸萃取後,將所得之核酸透過手持式等溫PCR 進行核酸擴增,可在現地進行試驗與目視判定結果,為行動工作站之架構工具。針對現階段開發之植物核酸擴增引子持續優化,並以Colletotrichum siamense ML133、木黴菌Trichoderma sp. ML001 與ML1425 為測試樣本,進行核酸擴增。透過LAMP PCR 檢測,炭疽病菌核酸可產生反應片段;而木黴菌核酸擴增反應不會有產物,顯示引子具專一性。續以健康及接種炭疽病之草莓葉片進行植株驗證測試,結果顯示,萃取液選擇不同與萃取核酸體積不同均可進行核酸擴增。採用羥基萘酚藍(HNB) 指示染料,陽性擴增樣品的顏色為天藍色,陰性擴增為紫羅蘭色,前加或後加在正對照或負對照所對應之顏色無明顯差異,可有效協助可視化判讀進行。進一步以不同菌種進行LAMP
PCR 專一性測試並以呈色法確認結果。其中臺灣草莓主要炭疽病菌Colletotrichum siamense、C. fructicola,只需30 分鐘即可檢知。相關研發成果於111 年度智慧農工科技發展論壇展區展示。
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